Según Roy Schestowitz, de CNet, la fusión tendría un efecto negativo sobre los usuarios de GNU/Linux.
Yahoo lleva ya un tiempo trabajando codo a codo con los desarrolladores de código abierto y organiza talleres y financia algunos proyectos de código de software libre como KDE, WordPress y Drupal. Si Microsoft comprase Yahoo, estos proyectos podrían quedarse sin una fuente importante de ingresos. Por otro lado, Yahoo utiliza mucho software de código abierto, software que sería sustituido seguramente por el de Microsoft.
Uno de los objetivos sería Zimbra, que Yahoo compró hace un año. Se suponía que iba a ser el rival de Microsoft Outlook, Exchange y de algunas de las partes de sus servicios “Live”. Y con toda seguridad, los servidores accionados por FreeBSD tienen los días contados si Microsoft se convierte en propietaria de Yahoo.
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